Theo Tổng cục Thống kê, nuôi cá tra vẫn gặp khó khăn do giá không ổn định, những tháng đầu năm giá tăng cao nhưng các tháng sau giá giảm trong khi giá cả các yếu tố đầu vào tăng như: Giá thuốc, thức ăn, nhiên liệu,… gây tâm lý e ngại và chưa khuyến khích các hộ mạnh dạn đầu tư mở rộng diện tích thả nuôi.

Mặc dù Chính phủ đưa ra gói hỗ trợ 9.000 tỷ đồng cho ngành cá tra, với mức lãi suất cho vay giảm nhưng đến nay người dân chưa mạnh dạn đầu tư nuôi lại vì thị trường tiêu thụ không ổn định, trong khi đó các nhà máy luôn trong tình trạng thiếu nguyên liệu. Đối với một bộ phận các doanh nghiệp nuôi cá tra quy mô lớn, do chủ động và thực hiện các biện pháp khắc phục khó khăn nên nhìn chung tương đối ổn định.

Theo tính toán cả năm 2012, sản lượng cá tra cả nước ước tính đạt 1,226 triệu tấn, tăng 3% so với năm 2011. Nhiều địa phương có diện tích và sản lượng cá tra giảm như: An Giang 927 ha, giảm 18%, sản lượng 186.000 tấn, giảm 8%; Vĩnh Long 507 ha, giảm 4%, sản lượng 80.000 tấn, giảm 6%; Trà Vinh 90 ha, giảm 35%, sản lượng 22.000 tấn, giảm 20%; Sóc Trăng 125 ha, giảm 25,6%, sản lượng 10.000 tấn, giảm 43%...

Tại các địa phương có các doanh nghiệp nuôi quy mô lớn thì sản lượng tăng khá như: Đồng Tháp đạt 383.000 tấn, tăng 16,5% so với năm trước; Bến Tre 136.000 tấn, tăng 38%; Cần Thơ 194.000 tấn, tăng 3%; Tiền Giang 26.000 tấn, tăng 35%.

Bên cạnh đó, nuôi tôm cũng gặp một số khó khăn do dịch bệnh đốm trắng, hoại tử gan, tụy lan rộng trên phần diện tích nuôi làm sản lượng thu hoạch tôm tại một số địa phương giảm như: Kiên Giang giảm 2%; Sóc Trăng giảm 18%; Long An giảm 13%; Trà Vinh giảm 59%.

Sản lượng thủy sản khai thác năm 2012 đạt 2,622 triệu tấn, tăng 4,3% so với năm 2011, trong đó khai thác biển đạt 2,418 triệu tấn, tăng 4,8%. Mô hình tổ đội kết hợp trong tổ chức khai thác biển nhằm tiết kiệm chi phí đang được các địa phương khuyến khích nhân rộng.

Hiện nay tàu thuyền đánh bắt tập trung chủ yếu vào khai thác có chọn lọc các loài thủy sản có giá trị kinh tế cao. Một số nghề đạt sản lượng khá là nghề cào, nghề lưới vây ánh sáng, nghề câu mực, đặc biệt là nghề câu cá lớn như cá ngừ. Sản lượng cá ngừ đại dương năm 2012 đạt 18 nghìn tấn, tăng 38% so với năm 2011.

Một số địa phương có sản lượng cá ngừ đại dương khai thác đạt khá trong năm là: Phú Yên 6.100 tấn, tăng 8% so với năm 2011; Bình Định 8.389 tấn, tăng 78,7%, Khánh Hòa 3.500 tấn, tăng 29,7%./.