Theo kết quả kiểm toán năm 2015 của Kiểm toán Nhà nước, tổng nợ xấu toàn hệ thống tại 31/12/2014 (theo báo cáo của các tổ chức tín dụng) là 145,2 nghìn tỷ đồng (tăng 28,7 nghìn tỷ đồng, tương ứng tăng 24,6% so với cuối năm 2013), chiếm 3,25% tổng dư nợ (giảm 0,36% so với năm 2013), theo đánh giá của NHNN là 4,83%. Trong đó, tỷ lệ nợ xấu của VDB cao và tăng nhanh (tỷ lệ nợ xấu tại 31/12/2014 là 11,05%, tăng 68% so với năm 2013).
Việc xử lý nợ xấu của các tổ chức tín dụng chủ yếu thông qua việc bán nợ cho VAMC, với 79,61 nghìn tỷ đồng trong tổng số 143,5 nghìn tỷ đồng nợ xấu được xử lý trong năm 2014. Tuy nhiên, theo đánh giá của Kiểm toán Nhà nước, xử lý nợ xấu của VAMC chưa hiệu quả, vì năm 2014 VAMC chỉ xử lý được 28 khoản nợ tương ứng 627 tỷ đồng trong tổng số 96.455 tỷ đồng nợ xấu đã mua.
Đáng chú ý nữa là các tổ chức tín dụng phân loại nợ chưa phù hợp. Do đó, Kiểm toán Nhà nước điều chỉnh cụ thể với ngân hàng BIDV là giảm dư nợ nhóm 1 là 379,6 tỷ đồng, tăng dư nợ nhóm 2 là 187,7 tỷ đồng, nhóm 3 là 133,1 tỷ đồng, nhóm 4 là 27,5 tỷ đồng, nhóm 5 là 9,5 tỷ đồng.
Tương tự, với ngân hàng VCB thì kiểm toán đã điều chỉnh giảm dư nợ nhóm 1 là 142,2 tỷ đồng, nhóm 3 là 1,2 tỷ đồng, nhóm 4 là 14,4 tỷ đồng, tăng dư nợ nhóm 2 là 144,8 tỷ đồng, nhóm 5 là 19,2 tỷ đồng;
Với ngân hàng Vietinbank thì kiểm toán điều chỉnh giảm dư nợ nhóm 1 là 142,4 tỷ đồng, tăng dư nợ nhóm 2 là 106,9 tỷ đồng, nhóm 5 là 35,5 tỷ đồng.
Một tồn tại khác của một số ngân hàng lớn được Kiểm toán Nhà nước chỉ ra là việc trích lập thiếu dự phòng rủi ro tín dụng, trong đó Vietinbank 20,5 tỷ đồng, BIDV 36,5 tỷ đồng, VCB 41,3 tỷ đồng.
Việc cho vay không đúng quy định nên chưa thu hồi được nợ xảy ra tại VCB chi nhánh Bắc Sài Gòn khi cho vay 18 khách hàng thuộc Hợp tác xã Hà Quang, huyện Củ Chi, thành phố Hồ Chí Minh 55,4 tỷ đồng, đến 31/12/2014 chưa thu hồi được gốc, lãi 52 tỷ đồng (nợ nhóm 5);
Ngân hàng VDB Chi nhánh Lạng Sơn cũng giải ngân trùng với Ngân hàng Nông nghiệp và Phát triển nông thôn Chi nhánh Lạng Sơn cho Công ty Cổ phần Xi măng Đồng Bành 127 tỷ đồng (mới thu hồi được 5 tỷ đồng).
VDB thì cân đối giữa huy động và sử dụng vốn chưa phù hợp, dẫn đến tồn đọng vốn lớn (số dư tiền gửi có kỳ hạn bình quân năm 2014 tại các tổ chức tín dụng là 13.226 tỷ đồng) làm gia tăng cấp bù chênh lệch lãi suất từ NSNN, chưa xây dựng hệ thống kiểm soát theo dõi, đánh giá về chất lượng tài sản có, quy định về quản lý thanh khoản, quản lý rủi ro theo quy định.../.