Đối với Giáo dục phổ thông, thanh tra Bộ sẽ tập trung thanh tra việc triển khai Đề án tiếng Anh trong giáo dục phổ thông; đổi mới phương pháp dạy học, kiểm tra, đánh giá; triển khai xây dựng và phát triển trường Trung học phổ thông chuyên, dạy học có yếu tố nước ngoài; Kiểm tra thực hiện quy định về tuyển sinh, quản lý dạy thêm, học thêm, thu chi kinh phí ngoài học phí và lệ phí tuyển sinh; Kiểm định chất lượng giáo dục, xây dựng trường ở các bậc đạt chuẩn quốc gia…
Đối với giáo dục chuyên nghiệp và đại học sẽ thanh tra việc thực hiện cam kết thành lập trường; mở ngành đào tạo, liên kết đào tạo, liên kết đào tạo có yếu tố nước ngoài; Thực hiện quy định công khai chất lượng giáo dục, các điều kiện bảo đảm chất lượng giáo dục…/.