Tuy nhiên, học sinh sẽ không phải đóng khoản thu này mà các trường có học sinh THCS dự thi sẽ trích từ nguồn kinh phí tự chủ của trường 29.900 đồng/học sinh và ngân sách Nhà nước cấp 65.200 đồng/học sinh. Với các môn thi chuyên, mức thu sẽ là 121.800 đồng/học sinh/môn thi.
Theo quy định của Sở Giáo dục và Đào tạo Hà Nội, đối với thí sinh là học sinh thuộc thành phố Hà Nội, học sinh sẽ phải đóng 85.000 đồng/học sinh/môn thi, ngân sách Nhà nước cấp 36.800 đồng/học sinh/môn thi. Đối với thí sinh là học sinh các tỉnh, thành phố khác (không có hộ khẩu Hà Nội) dự thi vào trường Trung học phổ thông Chu Văn An sẽ phải đóng 121.800 đồng/học sinh/môn thi.
Ngoài ra, học sinh sẽ phải đóng tiền bằng tốt nghiệp THCS với mức thu 12.000 đồng/học sinh, tiền bản sao bằng tốt nghiệp THCS sở 9.500 đồng/bản sao và tiền in giấy chứng nhận trúng tuyển vào lớp 10 THPT 5.000 đồng/học sinh./.