Ngày 1/7/1998, thương vụ chuyển nhượng Jaap Stam từ PSV Eindhoven đến MU chính thức có hiệu lực. Để có sự phục vụ của một trong những trung vệ hay nhất thế giới thời điểm đó, MU đã phải chi ra 10,6 triệu Bảng, kỷ lục chuyển nhượng cho một hậu vệ thời bấy giờ.
Dù bỏ ra khoản tiền lớn để chiêu mộ Stam nhưng MU đã không phải tiếc nuối. Cầu thủ người Hà Lan đã có 3 năm thi đấu rất thành công cùng MU khi Quỷ đỏ vô địch Ngoại hạng Anh 3 lần, 1 lần đăng quang Cúp C1 châu Âu, 1 FA Cup và 1 Cúp Liên lục địa. Stam chính là nhân tố chủ chốt trong đội hình MU giành cú ăn ba lịch sử mùa giải 1998/1999 với chức vô địch Cúp C1 châu Âu nhiều cảm xúc.
Chỉ thi đấu ở Anh 3 năm nhưng Jaap Stam đã được bình chọn là một trong những trung vệ hay nhất lịch sử Ngoại hạng Anh kể từ khi giải đấu này đổi tên năm 1992.
Sau khi rời MU năm 2001, Jaap Stam gia nhập Lazio và sau đó là Milan cũng như Ajax trước khi giải nghệ năm 2007./.