Rạng sáng 2/10, Filip Nguyễn cùng Slovan Liberec bước vào trận playoff Europa League gặp đối thủ APOEL. Đây là trận đấu được đánh giá khó khăn cho đại diện CH Séc khi APOEL có kinh nghiệm hơn ở đấu trường châu Âu.
Dù phải làm khách nhưng APOEL nhập cuộc tốt hơn. Họ liên tục tấn công uy hiếp khung thành thủ môn Filip Nguyễn. Ngay từ phút đầu, Filip Nguyễn đã phải ra tay cản phá đường chuyền của đối thủ. Phút 23, Filip Nguyễn lại băng ra kịp thời, hóa giải đường tấn công nguy hiểm của đội khách. Đến phút 52, Filip Nguyễn lại có pha cứu thua xuất thần khi cản phá cú đá của tiền đạo bên phía APOEL trong tình thế đối mặt.
Phong độ cao của Filip Nguyễn giúp các đồng đội ở phía trên tự tin hơn và bất ngờ đã xảy ra ở phút bù giờ cuối cùng. Slovan Liberec được hưởng quả phạt đền và từ chấm 11m, Mara đã dứt điểm chính xác, đưa đội bóng CH Séc tiến vào vòng bảng Europa League 2020/2021. Thủ thành thành Việt kiều Filip Nguyễn đã tự tạo nên lịch sử cho bản thân, khi lần đầu tiên anh sẽ tham dự vòng bảng Europa League.
Tại các trận đấu đáng chú ý khác, đội bóng của ông chủ Việt Nam - Sarajevo đã thất bại trước Celtic với tỷ số 0-1, qua đó lỡ cơ hội vào vòng bảng trong khi AC Milan vượt qua Rio Ave của Bồ Đào Nha theo cách vô cùng kịch tính trên chấm luân lưu với tỷ số 9-8 sau khi 2 đội hòa nhau 2-2 trong 120 phút.
Buổi lễ bốc thăm chia bảng Europa League 2020/21 sẽ diễn ra trong ngày 2/10 tại Thụy Sĩ./.