Ước tính mỗi năm nguồn thu từ các công trình thủy điện nhỏ này đạt hơn 18 tỷ đồng. Tuy nhiên, hầu hết các nhà máy thủy điện này chưa thực hiện nghĩa vụ nộp tiền, trong đó mới có 8 đơn vị ký hợp đồng trách nhiệm.
Nguyên nhân được các đơn vị này đưa ra là do Tập đoàn Điện lực Việt Nam chưa thanh toán chi trả tiền dịch vụ môi trường rừng, mặt khác chưa đưa chi phí tiền dịch vụ môi trường vào hợp đồng mua điện với các nhà máy thủy điện vừa và nhỏ./.