Theo đó, phí bảo vệ môi trường đối với khai thác khoáng sản phải nộp trong kỳ nộp phí được tính như sau: Phí bảo vệ môi trường đối với khai thác khoáng sản trong kỳ (đồng) bằng Số lượng từng loại khoáng sản khai thác trong kỳ (tấn hoặc m3) nhân (x) mức phí phải nộp của từng loại khoáng sản tương ứng (đồng/tấn hoặc đồng/m3).
Thông tư cũng qui định số lượng khoáng sản khai thác trong kỳ để xác định số phí bảo vệ môi trường đối với khoáng sản không kim loại và khoáng sản kim loại.
Trường hợp, trong quá trình khai thác mà thu được thêm loại khoáng sản khác thì phải nộp phí bảo vệ môi trường theo mức thu của loại khoáng sản được cơ quan nhà nước có thẩm quyền cấp phép khai thác…
Ngoài ra, tổ chức, cá nhân khai thác khoáng sản làm vật liệu xây dựng thông thường trong diện tích đất ở thuộc quyền sử dụng đất của hộ gia đình, cá nhân để xây dựng các công trình của hộ gia đình, cá nhân trong diện tích đó; trường hợp đất khai thác để san lấp, xây dựng công trình an ninh, quân sự thì không phải nộp phí bảo vệ môi trường đối với khai thác khoáng sản đó.
Thông tư có hiệu lực thi hành từ ngày 1/1/2012./.
