Dự án đầu tư xây dựng sân bay Phan Thiết đã được tỉnh Bình Thuận tập trung chỉ đạo triển khai trong thời gian qua. Đến nay, Ủy ban nhân dân thành phố Phan Thiết đã cơ bản phê duyệt phương án bồi thường, hỗ trợ cho các cá nhân, tổ chức bị thu hồi đất thuộc dự án với tổng kinh phí khoảng 152 tỷ đồng/543 héc-ta; đã chi trả tiền bồi thường và nhận bàn giao mặt bằng 399 héc-ta/543 héc-ta với kinh phí 66 tỷ đồng, đạt 74% diện tích. 
Theo Ủy ban nhân dân tỉnh Bình Thuận, khó khăn nhất hiện nay là không có kinh phí để chi trả cho người dân bị thu hồi đất mặc dù đã được phê duyệt phương án bồi thường, hỗ trợ. Nếu kéo dài sẽ gây bức xúc trong nhân dân, gây khiếu nại, khiếu kiện và cản trở việc thu hồi đất.
Trước đó, ngày 10/12/2016, Bộ Quốc phòng đã ban hành Quyết định phê duyệt tạm ứng ngân sách quốc phòng năm 2016 (với số tiền 40 tỷ đồng) của Bộ Tổng Tham mưu để chi trả bồi thường, hỗ trợ giải phóng mặt bằng sân bay Phan Thiết. Sau đó, Bộ Tổng Tham mưu cũng đã Ủy ban nhân dân tỉnh Bình Thuận liên hệ làm việc với Cục Tác chiến, Bộ Tổng Tham mưu để thực hiện tạm ứng kinh phí.